El CIBNOR garantiza la disponibilidad de la infraestructura física y los recursos para el desarrollo de las investigaciones de los estudiantes al disponer en las Sedes CIBNOR de laboratorios de investigación y áreas de apoyo a la investigación, 6 colecciones taxonómicas y de investigación, cubículos para estudiantes (158 estaciones de trabajo) e investigadores (120 cubículos), cafetería, zona deportiva, oficinas, un auditorio para 176 personas (con butacas), 9 salas de usos múltiples, una subdirección de informática y una oficina de enlace que cuenta con 6 estudios temporales para albergar estudiantes y/o invitados.

En el CIBNOR, además de la infraestructura destinada a investigación, el Programa de Estudios de Posgrado cuenta con edificios propios para la realización de las actividades académicas y de índole administrativo para la atención de sus estudiantes y profesores.